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研究所緊緊圍繞國家和黑龍江省經濟社會、科技發展中的重大科技問題，立足黑龍江省豐富的自然資源和生態稟賦，全力推進科研1234工程，超前謀劃，頂層設計，加強原始創新、特色項目的研發，不斷提高自主創新能力。
重點在濕地生態、生物多樣性、環境生態恢復、全球變化與碳排放、火山植被生態演化、植物營養與土壤化學、園林植物與花卉及其生物技術、動植物資源保護與合理利用、生物質資源、國土資源規劃與整治、數字資源與數字生態、區域可持續發展等領域開展科學研究。承擔國家、省部級重點科研項目200余項，取得科研成果150余項，獲得國家科學技術進步二等獎等科技獎勵50余項，發明專利10余項，發表論文1000余篇。與美國、加拿大、意大利、俄羅斯、日本等國家，以及中國科學院、哈爾濱工業大學等國內外學術單位建立了良好的合作關系。
目前，研究所已形成以國家工程實驗室為主體的5大科技平臺，以定位研究站為依托的4大科研基地，以及12個特色研究方向的多學科聯動的科學研究體系。努力把研究所建設成為以“開放、聯合”為科研方針，以自主創新為研究核心，以政府決策、公益事業和經濟社會發展為服務目標，具有科技引領與示范作用的新型區域自然資源與生態保護研究中心。
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